Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HIRAP54198 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIRAP54198 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms