Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOSBP53539 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOSBP53539 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOSBP53539 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOSBP53539 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms