Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms