Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NESP48681 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NESP48681 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NESP48681 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NESP48681 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NESP48681 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NESP48681 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NESP48681 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms