Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB2P47870 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms