Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms