Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms