Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6P35125 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6P35125 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6P35125 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6P35125 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms