Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms