Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms