Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms