Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMBRP28336 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NMBRP28336 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMBRP28336 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms