Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO2P25791 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO2P25791 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO2P25791 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO2P25791 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMO2P25791 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms