Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms