Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms