Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms