Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms