Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms