Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFMP07197 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFMP07197 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFMP07197 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFMP07197 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms