Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG5P05408 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG5P05408 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG5P05408 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG5P05408 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG5P05408 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms