Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA1P02647 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA1P02647 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA1P02647 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA1P02647 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOA1P02647 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms