Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNSO60931 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms