Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms