Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EEF1E1O43324 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EEF1E1O43324 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms