Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms