Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms