Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms