Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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