Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms