Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSAPA4D1B5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSAPA4D1B5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms