Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms