Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms