Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms