Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms