Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms