Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFDP1Q9UEE9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms