Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms