Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD5Q9P267 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms