Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms