Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms