Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms