Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms