Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF275Q9NSD4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms