Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms