Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLMQ9NP87 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms