Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM27Q9HBJ8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms