Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms