Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF6Q9BYE7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms