Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms