Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARD11Q9BXL7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms